Certaines personnes ont le pouvoir de transformer des objets en d'autres objets : on les appelle des "alchimistes". Cette transformation doit obéir à une certaine règle : l'objet transformé et l'objet issu de la transformation doivent être de masses équivalentes. Edward Elric est, malgré son jeune âge, un fameux alchimiste qui a perdu son petit frère, Alphonse, lors
d'une expérience de transformation interdite.
Il a cependant réussi à enfermer l'âme de
celui-ci dans une grande armure en fer.
L'aventure des deux frères commence quand
ils décident de partir à la recherche d'un objet
aux mystérieux pouvoirs capable de les aider à
retrouver leurs corps initiaux...